Εργογραφία
Ο Καΐρης έγραψε πολλά φιλοσοφικά και επιστημονικά έργα:
Γνωστική ή των του ανθρώπου γνώσεων σύντομος έκθεσις (Αθήνα 1849)
Στοιχεία Φιλοσοφίας ή των περί τα όντα γενικώτερον θεωρουμένων τα στοιχειωδέστερα (Αθήνα 1851)
Φιλοσοφικά και Φιλολογικά (Πάτρα 1875, το πρώτο μέρος με τον τίτλο Φιλοσοφικά επανεκδόθηκε στην Αθήνα το 1910)
Σχετικά με τη «Θεοσέβεια», έγραψε τέσσερα βιβλία που εκδόθηκαν στο Λονδίνο:
Θεοσεβών προσευχή (1848)
Επιτομή της θεοσεβικής διδασκαλίας και ηθικής (1852)
Διαγωγή θεοσεβούς (1852)
Θεοσεβών προσευχαί και ιερά άσματα (1852)
Επίσης, ο Καΐρης άφησε σε χειρόγραφη μορφή τη Φυσική, μια Πραγματεία Ποσοτικής.